定量Pcr診斷卡氏肺孢子蟲病特異性高
據(jù)第8屆國際逆轉(zhuǎn)錄病毒和機會性感染會議文獻(xiàn)載,美國Larson等的研究表明,定量PCR在卡氏肺孢子蟲肺炎診斷中有一定作用,可以顯著提高診斷的陽性預(yù)測值。
卡氏肺孢子蟲(Pc)是免疫抑制病人肺炎的重要病因。診斷卡氏肺孢子蟲肺炎的金標(biāo)準(zhǔn)是呼吸道標(biāo)本如誘導(dǎo)祛痰(IS)或支氣管肺泡灌洗液(BAL)顯微鏡檢查。分子生物學(xué)方法(例如PCR)亦被用于IS、BAL和口腔洗漱液(OW)的檢查。由于分子生物學(xué)方法敏感性高,Pc DNA曾在未患卡氏肺孢子蟲肺炎的病人中檢測出(假陽性),這降低了該方法的臨床特異性和陽性預(yù)測值。Larson等推測,定量分析或許有助于鑒別假陽性和真陽性Pc PCR檢測結(jié)果,因為假陽性(定殖或攜帶)的拷貝數(shù)有可能比真陽性低。
研究者建立了一種臨床診斷Pc的快速、定量的實時PCR技術(shù),該方法所需時間包括DNA提取在內(nèi)不超過4小時。他們改進(jìn)了以Pc多拷貝MSG基因作為目標(biāo)的PCR技術(shù),并且設(shè)計了熒光共振能轉(zhuǎn)換(fluoresence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)檢測探針。將克隆的目標(biāo)序列連續(xù)10倍稀釋,作為定量標(biāo)準(zhǔn)。用另一個FRET探針檢測模擬物作為內(nèi)對照。病人的標(biāo)本分成3份。研究者對以前做過PCR檢測的56例病人的128份呼吸道標(biāo)本(30份BAL,19份 IS和79份OW)進(jìn)行了回顧性盲法研究。因為目的是研究定量分析的實用性,研究者故意選擇假陽性率較高的標(biāo)本(根據(jù)以前的PCR結(jié)果),并與隨機標(biāo)本比較。檢查者對所有資料一無所知。所有標(biāo)本至少有一張陽性涂片(IS或BAL)作為診斷依據(jù)。
研究者提示,在評估下述結(jié)果時,應(yīng)考慮選擇樣本的偏向(即特異性和陽性預(yù)測值比隨機樣本低)。結(jié)果顯示,假陽性標(biāo)本拷貝數(shù)有偏低傾向,這種傾向存在于所有各類樣本。IS和BAL標(biāo)本檢測的敏感性為1.00,特異性為0.65,陽性預(yù)測值為0.62,陰性預(yù)測值為1.00。如果將10個拷貝/試管作為診斷標(biāo)準(zhǔn),陽性預(yù)測值升至0.89而陰性預(yù)測值降至0.94。對于OW#1標(biāo)本(即連續(xù)取2份口腔洗漱液標(biāo)本中的第一份,共50份),敏感性為0.94,特異性為0.90,陽性預(yù)測值為0.85,陰性預(yù)測值為0.97。仍將10個拷貝/試管作為診斷標(biāo)準(zhǔn),陽性預(yù)測值升至1.00而陰性預(yù)測值降至0.91。
Larson等指出,還需做進(jìn)一步的研究才能得到肯定結(jié)論。, 百拇醫(yī)藥(央視新聞)
卡氏肺孢子蟲(Pc)是免疫抑制病人肺炎的重要病因。診斷卡氏肺孢子蟲肺炎的金標(biāo)準(zhǔn)是呼吸道標(biāo)本如誘導(dǎo)祛痰(IS)或支氣管肺泡灌洗液(BAL)顯微鏡檢查。分子生物學(xué)方法(例如PCR)亦被用于IS、BAL和口腔洗漱液(OW)的檢查。由于分子生物學(xué)方法敏感性高,Pc DNA曾在未患卡氏肺孢子蟲肺炎的病人中檢測出(假陽性),這降低了該方法的臨床特異性和陽性預(yù)測值。Larson等推測,定量分析或許有助于鑒別假陽性和真陽性Pc PCR檢測結(jié)果,因為假陽性(定殖或攜帶)的拷貝數(shù)有可能比真陽性低。
研究者建立了一種臨床診斷Pc的快速、定量的實時PCR技術(shù),該方法所需時間包括DNA提取在內(nèi)不超過4小時。他們改進(jìn)了以Pc多拷貝MSG基因作為目標(biāo)的PCR技術(shù),并且設(shè)計了熒光共振能轉(zhuǎn)換(fluoresence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)檢測探針。將克隆的目標(biāo)序列連續(xù)10倍稀釋,作為定量標(biāo)準(zhǔn)。用另一個FRET探針檢測模擬物作為內(nèi)對照。病人的標(biāo)本分成3份。研究者對以前做過PCR檢測的56例病人的128份呼吸道標(biāo)本(30份BAL,19份 IS和79份OW)進(jìn)行了回顧性盲法研究。因為目的是研究定量分析的實用性,研究者故意選擇假陽性率較高的標(biāo)本(根據(jù)以前的PCR結(jié)果),并與隨機標(biāo)本比較。檢查者對所有資料一無所知。所有標(biāo)本至少有一張陽性涂片(IS或BAL)作為診斷依據(jù)。
研究者提示,在評估下述結(jié)果時,應(yīng)考慮選擇樣本的偏向(即特異性和陽性預(yù)測值比隨機樣本低)。結(jié)果顯示,假陽性標(biāo)本拷貝數(shù)有偏低傾向,這種傾向存在于所有各類樣本。IS和BAL標(biāo)本檢測的敏感性為1.00,特異性為0.65,陽性預(yù)測值為0.62,陰性預(yù)測值為1.00。如果將10個拷貝/試管作為診斷標(biāo)準(zhǔn),陽性預(yù)測值升至0.89而陰性預(yù)測值降至0.94。對于OW#1標(biāo)本(即連續(xù)取2份口腔洗漱液標(biāo)本中的第一份,共50份),敏感性為0.94,特異性為0.90,陽性預(yù)測值為0.85,陰性預(yù)測值為0.97。仍將10個拷貝/試管作為診斷標(biāo)準(zhǔn),陽性預(yù)測值升至1.00而陰性預(yù)測值降至0.91。
Larson等指出,還需做進(jìn)一步的研究才能得到肯定結(jié)論。, 百拇醫(yī)藥(央視新聞)
百拇醫(yī)藥網(wǎng) http://www.www.srpcoatings.com/Html/Dir0/11/10/22.htm