限制性內(nèi)切酶在非特異DNA上的滑動
與Aggarwal在今年五月的Molecular Cell上報道解析了BamHI結(jié)合在非特異性DNA上的結(jié)晶結(jié)構(gòu),此結(jié)構(gòu)為滑行模型中的中間復(fù)合物提供了原子細節(jié)。
復(fù)合物的結(jié)構(gòu)顯示,BamHI雙體以開放模式松散的結(jié)合在DNA上,Viadiu
與Aggarwal確實發(fā)現(xiàn)DNA分子在非特異性復(fù)合物的結(jié)合縫隙中滑落。而且,特異性位點的單堿基突變導(dǎo)致DNA與蛋白質(zhì)之間主干堿基特異性接觸缺失,這個缺失可能讓DNA與蛋白之間的滑動可以進行。
這項研究有助于解釋限制性內(nèi)切酶的特異性原因,為什么蛋白與非特異性DNA的結(jié)合有利于滑動而不利于切割。目前還存在的問題是BamHI究竟是沿著DNA單面滑動還是沿著大溝滑動?
相關(guān)文章:
Original research paper
Viadiu, H. & Aggarwal, A. K. Structure of BamHI bound to nonspecific DNA: a model for DNA sliding. Mol. Cell 5,889–895 (2000). REVIEWS
von Hippel, P. H. Protein–DNA recognition: new
perspectives and underlying themes. Science 263, 769–770 (1994).
Further reading
Guthold, M. et al. Direct observation of one-dimensional diffusion and transcription by Escherichia coli RNA
polymerase. Biophys. J. 77, 2284–2294 (1999).
Viadiu, H., Kucera, R., Schildkraut, I. &
Aggarwal, A. K. Crystallization of restriction endonuclease BamHI with Non-specific DNA. J. Struct. Biol. (in the press)., http://www.www.srpcoatings.com
復(fù)合物的結(jié)構(gòu)顯示,BamHI雙體以開放模式松散的結(jié)合在DNA上,Viadiu
與Aggarwal確實發(fā)現(xiàn)DNA分子在非特異性復(fù)合物的結(jié)合縫隙中滑落。而且,特異性位點的單堿基突變導(dǎo)致DNA與蛋白質(zhì)之間主干堿基特異性接觸缺失,這個缺失可能讓DNA與蛋白之間的滑動可以進行。
這項研究有助于解釋限制性內(nèi)切酶的特異性原因,為什么蛋白與非特異性DNA的結(jié)合有利于滑動而不利于切割。目前還存在的問題是BamHI究竟是沿著DNA單面滑動還是沿著大溝滑動?
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perspectives and underlying themes. Science 263, 769–770 (1994).
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polymerase. Biophys. J. 77, 2284–2294 (1999).
Viadiu, H., Kucera, R., Schildkraut, I. &
Aggarwal, A. K. Crystallization of restriction endonuclease BamHI with Non-specific DNA. J. Struct. Biol. (in the press)., http://www.www.srpcoatings.com
百拇醫(yī)藥網(wǎng) http://www.www.srpcoatings.com/Html/Info/News/67/06702.htm