有關(guān)連鎖不平衡分析的新觀點(diǎn)
如將人類(lèi)基因組完全分解成堿基的序列,那么對(duì)人類(lèi)自身就沒(méi)有太大的意義了,因?yàn)檫@將難以認(rèn)識(shí)到基因組高水平的組織。由于堿基分布的不均一性,基因組的各區(qū)域也表現(xiàn)出不同的性質(zhì)。LD(linkage
disequilibrium)能提供對(duì)疾病基因克隆所需要的重要信息,F(xiàn)在Eisenbarth et al.已在基因組的一個(gè)區(qū)段觀察到了堿基組成與LD之間的聯(lián)系。
LD指出兩個(gè)loci相距很近時(shí),它們之間的重組就會(huì)很少,兩者的重組率比這兩個(gè)loci在基因組中隨機(jī)分布的重組率遠(yuǎn)遠(yuǎn)的小。
如果利用足夠的標(biāo)記,檢測(cè)標(biāo)記與疾病基因的LD對(duì)該可能致病基因的定位很有幫助。然而基因組各處的重組率不盡相同,多少個(gè)標(biāo)記才會(huì)比較合適呢?
NF1(neurofibromatosis)基因,位于基因組的一個(gè)特殊區(qū)段,此區(qū)段連接著兩個(gè)G-C含量差別很大的片段。Eisenbarth et al.發(fā)現(xiàn)高G-C含量與較低的LD相關(guān)聯(lián),從LD的程度,可以估計(jì)這兩個(gè)片段的重組率相差約100倍,每一個(gè)片段都綿延數(shù)百Kb。
如果此結(jié)論在基因組的其他地方也成立的話,G-C含量就能幫助預(yù)測(cè)LD的程度了。
相關(guān)文章:
ORIGINAL RESEARCH PAPER
Eisenbarth , I. et al. An
isochore transition in the NF1 gene region coincides with a switch in
the extent of linkage disequilibrium. Am. J. Hum. Genet. 67, 873
–880 (2000) PubMed
FURTHER READING
Risch, N. J. Searching for
genetic determinants in the new millennium . Nature 405, 847–856 (2000) [ Abstract] PubMed
Kruglyak, L. Prospects for
whole-genome linkage disequilibrium mapping of common disease genes.
Nature Genet. 22, 139– 144 (1999), http://www.www.srpcoatings.com
disequilibrium)能提供對(duì)疾病基因克隆所需要的重要信息,F(xiàn)在Eisenbarth et al.已在基因組的一個(gè)區(qū)段觀察到了堿基組成與LD之間的聯(lián)系。
LD指出兩個(gè)loci相距很近時(shí),它們之間的重組就會(huì)很少,兩者的重組率比這兩個(gè)loci在基因組中隨機(jī)分布的重組率遠(yuǎn)遠(yuǎn)的小。
如果利用足夠的標(biāo)記,檢測(cè)標(biāo)記與疾病基因的LD對(duì)該可能致病基因的定位很有幫助。然而基因組各處的重組率不盡相同,多少個(gè)標(biāo)記才會(huì)比較合適呢?
NF1(neurofibromatosis)基因,位于基因組的一個(gè)特殊區(qū)段,此區(qū)段連接著兩個(gè)G-C含量差別很大的片段。Eisenbarth et al.發(fā)現(xiàn)高G-C含量與較低的LD相關(guān)聯(lián),從LD的程度,可以估計(jì)這兩個(gè)片段的重組率相差約100倍,每一個(gè)片段都綿延數(shù)百Kb。
如果此結(jié)論在基因組的其他地方也成立的話,G-C含量就能幫助預(yù)測(cè)LD的程度了。
相關(guān)文章:
ORIGINAL RESEARCH PAPER
Eisenbarth , I. et al. An
isochore transition in the NF1 gene region coincides with a switch in
the extent of linkage disequilibrium. Am. J. Hum. Genet. 67, 873
–880 (2000) PubMed
FURTHER READING
Risch, N. J. Searching for
genetic determinants in the new millennium . Nature 405, 847–856 (2000) [ Abstract] PubMed
Kruglyak, L. Prospects for
whole-genome linkage disequilibrium mapping of common disease genes.
Nature Genet. 22, 139– 144 (1999), http://www.www.srpcoatings.com
百拇醫(yī)藥網(wǎng) http://www.www.srpcoatings.com/Html/Info/News/67/06771.htm