深圳地區(qū)手足病腸道病毒5′端非編碼區(qū)部分基因克隆和序列分析
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深圳市寶安區(qū)人民醫(yī)院兒科 深圳518101 張壽斌;廖華;黃呈輝;李婉華;譚慶瑜
腸道病毒|手足口病|5′端非編碼區(qū)(5′UTR)|序列分析|分子生物學(xué)
參見附件(50kb)。
深圳市寶安區(qū)人民醫(yī)院兒科 深圳518101 張壽斌;廖華;黃呈輝;李婉華;譚慶瑜
關(guān)鍵詞:腸道病毒;手足口;5′端非編碼區(qū)(5′UTR);序列分析;分子生物學(xué)
摘要:目的 :分析深圳地區(qū)手足口病病人腸道病毒 (EV) 5′端非編碼區(qū) (5′UTR)部分基因序列 ,了解本地區(qū)手足口病病人EV感染的基因型。方法 :設(shè)計特異性引物 ,建立檢測EV的RT PCR方法 ,對臨床疑診為EV感染的病人的糞便和 /或咽拭子、腦脊液標(biāo)本進行檢測 ,并對 5例典型手足口病病人中分離株的PCR陽性擴增產(chǎn)物進行克隆和序列測定。結(jié)果 :分離出的 5株EV 5′UTR基因的核苷酸同源性為 85 .5 %~ 99.3% ,與EV71BrCr原株、CVA9、CVA16和CVB3同源性為 86 .3%~ 93.3%。結(jié)論 :深圳地區(qū)手足口病EV 5′UTR與幾種常見的腸道病毒血清型同源性均較高 ,提示可能存在多種基因.
深圳市寶安區(qū)人民醫(yī)院兒科 深圳518101 張壽斌;廖華;黃呈輝;李婉華;譚慶瑜
關(guān)鍵詞:腸道病毒;手足口;5′端非編碼區(qū)(5′UTR);序列分析;分子生物學(xué)
摘要:目的 :分析深圳地區(qū)手足口病病人腸道病毒 (EV) 5′端非編碼區(qū) (5′UTR)部分基因序列 ,了解本地區(qū)手足口病病人EV感染的基因型。方法 :設(shè)計特異性引物 ,建立檢測EV的RT PCR方法 ,對臨床疑診為EV感染的病人的糞便和 /或咽拭子、腦脊液標(biāo)本進行檢測 ,并對 5例典型手足口病病人中分離株的PCR陽性擴增產(chǎn)物進行克隆和序列測定。結(jié)果 :分離出的 5株EV 5′UTR基因的核苷酸同源性為 85 .5 %~ 99.3% ,與EV71BrCr原株、CVA9、CVA16和CVB3同源性為 86 .3%~ 93.3%。結(jié)論 :深圳地區(qū)手足口病EV 5′UTR與幾種常見的腸道病毒血清型同源性均較高 ,提示可能存在多種基因.
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